一部の項目を除き、IDD-IDA01-IDCにて変更可能です。
変更可能な項目は、下記業務仕様書に記載しています。

• IDA01（輸出申告変更事項登録）業務仕様書｜7.特記事項｜（9）変更不可項目について
  なお、変更可能項目以外の変更は、申告撤回が必要です。